Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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KncnQ307W7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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KncnQ307W7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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KncnQ307W7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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KncnQ307W7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KncnQ307W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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KncnQ307W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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KncnQ307W7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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KncnQ307W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KncnQ307W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KncnQ307W7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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KncnQ307W7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KncnQ307W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KncnQ307W7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KncnQ307W7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KncnQ307W7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KncnQ307W7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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KncnQ307W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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KncnQ307W7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KncnQ307W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KncnQ307W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms