Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TYSND1Q2T9J0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TYSND1Q2T9J0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TYSND1Q2T9J0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TYSND1Q2T9J0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms