Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SPHKAPQ2M3C7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SPHKAPQ2M3C7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SPHKAPQ2M3C7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SPHKAPQ2M3C7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SPHKAPQ2M3C7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SPHKAPQ2M3C7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SPHKAPQ2M3C7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms