Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC96Q2M329 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC96Q2M329 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC96Q2M329 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC96Q2M329 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC96Q2M329 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms