Protein–RNA interactions for Protein: Q2M296

MTHFSD, Methenyltetrahydrofolate synthase domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSDQ2M296 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MTHFSDQ2M296 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MTHFSDQ2M296 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MTHFSDQ2M296 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MTHFSDQ2M296 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MTHFSDQ2M296 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MTHFSDQ2M296 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
MTHFSDQ2M296 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MTHFSDQ2M296 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MTHFSDQ2M296 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MTHFSDQ2M296 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms