Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RSPO4Q2I0M5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RSPO4Q2I0M5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPO4Q2I0M5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPO4Q2I0M5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPO4Q2I0M5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RSPO4Q2I0M5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RSPO4Q2I0M5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPO4Q2I0M5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPO4Q2I0M5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RSPO4Q2I0M5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RSPO4Q2I0M5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms