Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Samd11Q1RNF8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Samd11Q1RNF8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Samd11Q1RNF8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samd11Q1RNF8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd11Q1RNF8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd11Q1RNF8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
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