Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CSPP1Q1MSJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms