Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF1Q17RB8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF1Q17RB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms