Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TXNRD1Q16881 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
TXNRD1Q16881 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TXNRD1Q16881 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TXNRD1Q16881 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
TXNRD1Q16881 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TXNRD1Q16881 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms