Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3AQ16821 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R3AQ16821 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R3AQ16821 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R3AQ16821 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R3AQ16821 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms