Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
DDB1Q16531 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDB1Q16531 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DDB1Q16531 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
DDB1Q16531 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
DDB1Q16531 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DDB1Q16531 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DDB1Q16531 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
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