Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNGA3Q16281 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA3Q16281 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNGA3Q16281 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA3Q16281 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGA3Q16281 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGA3Q16281 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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