Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF56Q15929 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF56Q15929 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF56Q15929 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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