Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85BQ15834 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC85BQ15834 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC85BQ15834 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC85BQ15834 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85BQ15834 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC85BQ15834 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85BQ15834 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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