Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD1Q15797 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD1Q15797 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD1Q15797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD1Q15797 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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