Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TWIST1Q15672 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TWIST1Q15672 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TWIST1Q15672 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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TWIST1Q15672 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWIST1Q15672 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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TWIST1Q15672 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWIST1Q15672 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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TWIST1Q15672 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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TWIST1Q15672 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWIST1Q15672 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWIST1Q15672 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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