Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAM1Q15629 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAM1Q15629 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAM1Q15629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAM1Q15629 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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