Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRADDQ15628 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRADDQ15628 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRADDQ15628 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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