Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A3R2Q15599 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A3R2Q15599 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3R2Q15599 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3R2Q15599 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms