Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF1AQ15573 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1AQ15573 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1AQ15573 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1AQ15573 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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