Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 213.26□□□□□ -0.293e-12■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 C12orf49-203ENST00000547630 1371 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.733e-11■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-11■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 C12orf49-202ENST00000547606 492 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-11■■■■■ 71.7
PCBP2Q15366 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 314.44□□□□□ -0.19e-88■■■■■ 71.6
PCBP2Q15366 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 414.11□□□□□ -0.159e-88■■■■■ 71.6
PCBP2Q15366 ASAP2-204ENST00000484590 3869 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 71.5
PCBP2Q15366 ASAP2-205ENST00000491413 497 ntTSL 47.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 71.5
PCBP2Q15366 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.164e-9■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.244e-9■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 38.96□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 TNKS1BP1-202ENST00000427750 1946 ntTSL 220.27■□□□□ 0.841e-12■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-12■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-12■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.31■□□□□ 0.041e-12■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 TNKS1BP1-206ENST00000532273 592 ntTSL 212.63□□□□□ -0.391e-12■■■■■ 71.4
PCBP2Q15366 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 71.3
PCBP2Q15366 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 71.3
PCBP2Q15366 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 THRAP3-204ENST00000478853 380 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.26■□□□□ 0.031e-50■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-15■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 AACS-205ENST00000441247 2536 ntTSL 511.4□□□□□ -0.593e-15■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 AACS-210ENST00000539251 555 ntTSL 410.89□□□□□ -0.673e-15■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 AACS-202ENST00000316543 3115 ntTSL 210.24□□□□□ -0.773e-15■■■■■ 70.9
PCBP2Q15366 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 512.49□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 70.6
PCBP2Q15366 MICAL3-203ENST00000400561 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 70.6
PCBP2Q15366 MICAL3-204ENST00000414725 4756 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 70.6
PCBP2Q15366 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 70.6
PCBP2Q15366 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 70.6
PCBP2Q15366 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 70.3
PCBP2Q15366 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-8■■■■■ 70.3
PCBP2Q15366 CMC1-207ENST00000468330 551 ntTSL 46.48□□□□□ -1.375e-15■■■■■ 70.1
PCBP2Q15366 CMC1-202ENST00000396610 593 ntTSL 25.61□□□□□ -1.515e-15■■■■■ 70.1
PCBP2Q15366 CMC1-206ENST00000467644 549 ntTSL 34.65□□□□□ -1.675e-15■■■■■ 70.1
PCBP2Q15366 CMC1-211ENST00000495428 608 ntTSL 34.28□□□□□ -1.725e-15■■■■■ 70.1
PCBP2Q15366 CMC1-203ENST00000418849 484 ntTSL 34.12□□□□□ -1.755e-15■■■■■ 70.1
PCBP2Q15366 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-14■■■■■ 70
PCBP2Q15366 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.892e-11■■■■■ 69.8
PCBP2Q15366 PARN-213ENST00000564904 468 ntTSL 53.68□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 69.5
PCBP2Q15366 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 216.04■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SETDB1-213ENST00000498193 3854 ntTSL 28.09□□□□□ -1.113e-20■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SETDB1-204ENST00000368964 548 ntTSL 55.64□□□□□ -1.513e-20■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SDCCAG3-210ENST00000481114 340 ntTSL 212.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SDCCAG3-205ENST00000417512 626 ntTSL 212.32□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SDCCAG3-207ENST00000461693 869 ntTSL 211.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 SDCCAG3-208ENST00000466579 496 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 69.4
PCBP2Q15366 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-12■■■■■ 69
PCBP2Q15366 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 311.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 69
PCBP2Q15366 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 68.8
PCBP2Q15366 PDZD8-204ENST00000489491 289 ntTSL 23.51□□□□□ -1.852e-10■■■■■ 68.8
PCBP2Q15366 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 68.8
PCBP2Q15366 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 68.8
PCBP2Q15366 GTPBP3-216ENST00000598038 2917 ntTSL 514.73□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 68.8
PCBP2Q15366 MAGI3-206ENST00000486456 897 ntTSL 518.8■□□□□ 0.61e-32■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-32■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.251e-32■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-32■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-32■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-14■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-14■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 PDCD6IP-208ENST00000465122 894 ntTSL 35.09□□□□□ -1.593e-14■■■■■ 68.7
PCBP2Q15366 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 56.94□□□□□ -1.33e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.33e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.323e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 55.2□□□□□ -1.583e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 MFSD14B-202ENST00000428393 2275 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 68.6
PCBP2Q15366 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.216e-20■■■■■ 68.4
PCBP2Q15366 ACACA-225ENST00000612120 566 ntTSL 45.92□□□□□ -1.461e-13■■■■■ 68.4
PCBP2Q15366 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 68.4
PCBP2Q15366 YWHAE-210ENST00000573026 780 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 68.4
PCBP2Q15366 YWHAE-211ENST00000573196 739 ntTSL 210.14□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 68.4
PCBP2Q15366 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 68.3
PCBP2Q15366 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 68.3
PCBP2Q15366 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 68.3
PCBP2Q15366 MROH1-205ENST00000527552 5832 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 68.3
PCBP2Q15366 MROH1-208ENST00000532255 3905 ntTSL 210.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 68.3
PCBP2Q15366 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.072e-13■■■■■ 68.1
PCBP2Q15366 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 12e-13■■■■■ 68.1
PCBP2Q15366 PLPP1-204ENST00000509667 971 ntTSL 519.68■□□□□ 0.742e-13■■■■■ 68.1
PCBP2Q15366 PLPP1-205ENST00000515132 677 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-13■■■■■ 68.1
PCBP2Q15366 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 68
PCBP2Q15366 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 68
PCBP2Q15366 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 68
PCBP2Q15366 S100A1-201ENST00000292169 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 68
PCBP2Q15366 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 67.9
PCBP2Q15366 HNRNPUL1-210ENST00000595806 1659 ntTSL 220.04■□□□□ 0.89e-19■■■■■ 67.9
PCBP2Q15366 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 67.5
PCBP2Q15366 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 67.4
PCBP2Q15366 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 67.3
PCBP2Q15366 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 67.3
PCBP2Q15366 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 67.3
PCBP2Q15366 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 67.3
PCBP2Q15366 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 67.3
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