Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ANKRD1Q15327 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ANKRD1Q15327 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ANKRD1Q15327 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ANKRD1Q15327 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ANKRD1Q15327 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ANKRD1Q15327 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.8 ms