Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETDB1Q15047 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETDB1Q15047 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SETDB1Q15047 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETDB1Q15047 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETDB1Q15047 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETDB1Q15047 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETDB1Q15047 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms