Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TNIP1Q15025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNIP1Q15025 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNIP1Q15025 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TNIP1Q15025 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TNIP1Q15025 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TNIP1Q15025 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
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