Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB39AQ14964 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB39AQ14964 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB39AQ14964 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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