Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPNMBQ14956 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPNMBQ14956 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GPNMBQ14956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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GPNMBQ14956 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GPNMBQ14956 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPNMBQ14956 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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