Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MDC1Q14676 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MDC1Q14676 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDC1Q14676 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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