Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLS1Q14651 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PLS1Q14651 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLS1Q14651 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLS1Q14651 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLS1Q14651 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PLS1Q14651 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms