Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM25Q14258 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM25Q14258 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM25Q14258 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM25Q14258 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM25Q14258 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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