Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFR3AQ14156 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFR3AQ14156 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EFR3AQ14156 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFR3AQ14156 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFR3AQ14156 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms