Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOFQ13790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOFQ13790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOFQ13790 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOFQ13790 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOFQ13790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOFQ13790 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOFQ13790 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOFQ13790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
APOFQ13790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOFQ13790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOFQ13790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOFQ13790 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APOFQ13790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOFQ13790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOFQ13790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOFQ13790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOFQ13790 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOFQ13790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOFQ13790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOFQ13790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOFQ13790 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOFQ13790 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOFQ13790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOFQ13790 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOFQ13790 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOFQ13790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOFQ13790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOFQ13790 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOFQ13790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOFQ13790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOFQ13790 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOFQ13790 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOFQ13790 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOFQ13790 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOFQ13790 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOFQ13790 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOFQ13790 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOFQ13790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOFQ13790 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOFQ13790 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOFQ13790 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOFQ13790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOFQ13790 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOFQ13790 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOFQ13790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOFQ13790 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOFQ13790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOFQ13790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOFQ13790 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOFQ13790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOFQ13790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOFQ13790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOFQ13790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOFQ13790 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOFQ13790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOFQ13790 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOFQ13790 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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