Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALCAMQ13740 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALCAMQ13740 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALCAMQ13740 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALCAMQ13740 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALCAMQ13740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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