Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FHL3Q13643 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FHL3Q13643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FHL3Q13643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FHL3Q13643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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