Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CUL4AQ13619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CUL4AQ13619 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CUL4AQ13619 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CUL4AQ13619 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CUL4AQ13619 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CUL4AQ13619 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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