Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX1Q13596 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX1Q13596 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX1Q13596 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX1Q13596 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX1Q13596 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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