Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TOP3AQ13472 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP3AQ13472 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP3AQ13472 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP3AQ13472 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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