Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ABHD4-207ENST00000541962 662 ntTSL 517.1■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 516.64■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 416.53■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-209ENST00000544562 929 ntTSL 213.65□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-205ENST00000537243 550 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-202ENST00000418446 1003 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-220ENST00000580617 1352 ntTSL 212.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 210.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-212ENST00000464381 2474 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ABHD4-210ENST00000545034 185 ntTSL 59.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-214ENST00000470782 3987 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -11e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 38.52□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 27.33□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ERO1A-208ENST00000556358 951 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 ERO1A-209ENST00000556769 934 ntTSL 54.45□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.165e-9■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.75■■□□□ 1.395e-9■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 DDX54-207ENST00000550016 594 ntTSL 524.01■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 SF3B2-210ENST00000530981 1080 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 TCOF1-203ENST00000394269 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 24.7
G3BP1Q13283 FTSJ3-213ENST00000583901 867 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 FTSJ3-212ENST00000583202 908 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 PRPF8-214ENST00000576585 2157 ntTSL 215.31■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-204ENST00000577901 917 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-209ENST00000585042 567 ntTSL 418.52■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-207ENST00000583879 719 ntTSL 26.54□□□□□ -1.362e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 32.55□□□□□ -22e-6■■■■□ 24.6
G3BP1Q13283 TRRAP-206ENST00000480695 805 ntTSL 414.59□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 427.59■■■□□ 2.012e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 524.37■■□□□ 1.493e-7■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 NUP93-208ENST00000563858 797 ntTSL 519.76■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 ALDH18A1-204ENST00000485428 726 ntTSL 210.96□□□□□ -0.655e-9■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 24.5
G3BP1Q13283 FTSJ3-204ENST00000579831 411 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.084e-20■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PKM-213ENST00000564993 663 ntTSL 214.13□□□□□ -0.158e-20■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 LDHA-208ENST00000469976 656 ntTSL 213.64□□□□□ -0.236e-39■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 CCT8-205ENST00000475205 431 ntTSL 28.43□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-202ENST00000371720 713 ntTSL 426.42■■□□□ 1.823e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-212ENST00000622209 1013 ntTSL 1 (best)26.04■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-207ENST00000612553 1174 ntTSL 225.6■■□□□ 1.693e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 PMPCA-206ENST00000610649 756 ntTSL 59.26□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 24.4
G3BP1Q13283 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt18.8■□□□□ 0.63e-13■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.443e-13■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-218ENST00000491494 371 ntTSL 221.12■□□□□ 0.979e-8■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 221.08■□□□□ 0.973e-9■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-202ENST00000416465 612 ntTSL 522.62■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DRG1-203ENST00000433341 808 ntTSL 38.76□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 PSMD2-206ENST00000439383 2633 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 216.52■□□□□ 0.238e-7■■■■□ 24.3
G3BP1Q13283 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 225.35■■□□□ 1.653e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 220.61■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.853e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 219.6■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ETNK1-203ENST00000538218 1659 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.872e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 317.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.78e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-218ENST00000633485 5863 ntTSL 59.55□□□□□ -0.888e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.928e-7■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.744e-10■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.994e-10■■■■□ 24.2
G3BP1Q13283 NDUFV1-228ENST00000534352 573 ntTSL 223.02■■□□□ 1.283e-12■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-210ENST00000509471 575 ntTSL 38.87□□□□□ -0.995e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -15e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-208ENST00000506705 1340 ntTSL 58.74□□□□□ -1.015e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.35e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PABPC1-221ENST00000522720 593 ntTSL 420.31■□□□□ 0.848e-14■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 DDX54-204ENST00000546898 479 ntTSL 319.67■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-8■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.518e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.228e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.088e-11■■■■□ 24.1
G3BP1Q13283 ATP5B-206ENST00000550162 863 ntTSL 216.35■□□□□ 0.215e-15■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 24
G3BP1Q13283 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24
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