Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.164e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.824e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 510.56□□□□□ -0.722e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 29.82□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-7■■■■□ 22.8
SRSF9Q13242 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC9.83□□□□□ -0.842e-12■■■■□ 22.7
SRSF9Q13242 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-12■■■■□ 22.7
SRSF9Q13242 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 47.48□□□□□ -1.211e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 26.47□□□□□ -1.371e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.611e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 40.44□□□□□ -2.341e-11■■■■□ 22.6
SRSF9Q13242 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-12■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.084e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-201ENST00000380875 6126 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-205ENST00000427623 1421 ntTSL 56.67□□□□□ -1.344e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 NCBP3-204ENST00000574911 2701 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 ATXN10-204ENST00000435026 653 ntTSL 36.46□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.384e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 26.23□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 NCBP3-203ENST00000574379 918 ntTSL 26.1□□□□□ -1.431e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 ATXN10-205ENST00000451241 514 ntTSL 34.77□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 ATXN10-210ENST00000493643 617 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 SEC63-204ENST00000459782 2025 ntTSL 1 (best)3.83□□□□□ -1.83e-12■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 FREM1-208ENST00000486223 815 ntTSL 32.1□□□□□ -2.074e-6■■■■□ 22.5
SRSF9Q13242 PIGZ-201ENST00000238138 868 ntTSL 216.16■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-210ENST00000624585 4667 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-202ENST00000549065 575 ntTSL 48.54□□□□□ -1.041e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-206ENST00000614614 712 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-207ENST00000616922 642 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-209ENST00000619784 903 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-205ENST00000612696 4119 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.361e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 DUXAP10-208ENST00000619091 1444 ntTSL 53.73□□□□□ -1.811e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 26.95□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 22.4
SRSF9Q13242 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 55.53□□□□□ -1.522e-11■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 45.36□□□□□ -1.552e-11■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 TRIM26-269ENST00000480999 3114 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-7■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.031e-7■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-7■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 510.52□□□□□ -0.725e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 29.94□□□□□ -0.825e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 29.73□□□□□ -0.855e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 59.22□□□□□ -0.935e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 29.12□□□□□ -0.955e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 29.04□□□□□ -0.965e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-236ENST00000490484 871 ntTSL 56.37□□□□□ -1.395e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-237ENST00000492779 2316 ntTSL 24.79□□□□□ -1.645e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-239ENST00000494274 704 ntTSL 34.47□□□□□ -1.695e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-244ENST00000615771 686 ntTSL 54.12□□□□□ -1.755e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 53.84□□□□□ -1.795e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-229ENST00000475651 555 ntTSL 53.16□□□□□ -1.95e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.975e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 52.43□□□□□ -2.025e-10■■■■□ 22.3
SRSF9Q13242 PRODH2-202ENST00000587695 1956 ntTSL 213.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22.2
SRSF9Q13242 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 22.2
SRSF9Q13242 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 218.38■□□□□ 0.537e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 317.08■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.297e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.267e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.27e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-212ENST00000439161 568 ntTSL 414.92□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 214.53□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.097e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.137e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 213.85□□□□□ -0.197e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 212.23□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-214ENST00000449944 927 ntTSL 511.96□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 211.71□□□□□ -0.537e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-215ENST00000453208 639 ntTSL 511.43□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 211.27□□□□□ -0.617e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-207ENST00000411501 661 ntTSL 311.13□□□□□ -0.634e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 210.95□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-211ENST00000431745 483 ntTSL 59.58□□□□□ -0.884e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-213ENST00000447515 577 ntTSL 49.14□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-210ENST00000429218 566 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 NCR3LG1-202ENST00000530403 2429 ntTSL 58.89□□□□□ -0.997e-7■■■■□ 22.1
SRSF9Q13242 GGA1-220ENST00000484804 449 ntTSL 38.69□□□□□ -1.024e-6■■■■□ 22.1
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