Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR1H3Q13133 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR1H3Q13133 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NR1H3Q13133 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NR1H3Q13133 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NR1H3Q13133 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR1H3Q13133 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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