Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAF1Q13077 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRAF1Q13077 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAF1Q13077 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAF1Q13077 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAF1Q13077 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAF1Q13077 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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