Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIK3Q13003 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIK3Q13003 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIK3Q13003 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GRIK3Q13003 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GRIK3Q13003 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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