Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RPN14YGL004C 1254 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YIL092WYIL092W 1902 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 NPL6YMR091C 1308 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 KEL3YPL263C 1956 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 NMD4YLR363C 657 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 NPP2YEL016C 1482 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 FET5YFL041W 1869 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 OPI3YJR073C 621 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 PEX22YAL055W 543 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 LIP2YLR239C 987 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1A-NL1Q12391 YMR244WYMR244W 1068 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 YOL107WYOL107W 1029 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 PRM4YPL156C 855 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 DAK2YFL053W 1776 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 MAS1YLR163C 1389 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 DBR1YKL149C 1218 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 YNL303WYNL303W 348 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 PTC7YHR076W 1032 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 SFL1YOR140W 2301 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 REX3YLR107W 1215 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 CRC1YOR100C 984 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 DTR1YBR180W 1719 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 COS6YGR295C 1146 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 MSA2YKR077W 1092 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 SPC24YMR117C 642 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 OSW1YOR255W 837 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 MEX67YPL169C 1800 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 BSP1YPR171W 1731 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 TVP23YDR084C 600 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 YNR029CYNR029C 1290 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 FES1YBR101C 873 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 snR31snR31 225 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-NL1Q12391 ECM9YKR004C 1134 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YLR169WYLR169W 354 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 CSI1YMR025W 888 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 SWT21YNL187W 1074 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MIM1YOL026C 342 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 ISR1YPR106W 1332 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YGR283CYGR283C 1026 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MAD2YJL030W 591 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 SNZ1YMR096W 894 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 VAM3YOR106W 852 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 snR189snR189 189 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YPR126CYPR126C 309 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 RER1YCL001W 567 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MET1YKR069W 1782 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YHR022CYHR022C 771 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 GPM1YKL152C 744 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YBL095WYBL095W 813 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 SUT2YPR009W 807 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MTO1YGL236C 2010 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 HBS1YKR084C 1836 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 TRP2YER090W 1524 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MHO1YJR008W 1017 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 MRPL24YMR193W 777 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 PUS7YOR243C 2031 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 SPS100YHR139C 981 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YHR145CYHR145C 357 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 POS5YPL188W 1245 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 ARR1YPR199C 885 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 THI6YPL214C 1623 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 HXT11YOL156W 1704 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 RBG2YGR173W 1107 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 KGD2YDR148C 1392 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 HAT2YEL056W 1206 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 TOK1YJL093C 2076 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YKR104WYKR104W 921 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 DSC2YOL073C 969 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 ADH1YOL086C 1047 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 RRP40YOL142W 723 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 ISA2YPR067W 558 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-NL1Q12391 YDR306CYDR306C 1437 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YLR198CYLR198C 360 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 ARC35YNR035C 1029 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 THI3YDL080C 1830 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 RTG3YBL103C 1461 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 AAT1YKL106W 1356 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 BUD16YEL029C 939 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 YOL079WYOL079W 399 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 TSR3YOR006C 942 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-NL1Q12391 GAL2YLR081W 1725 nt7.63□□□□□ -1.19
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