Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 CYT1YOR065W 930 nt9.14□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 DUR3YHL016C 2208 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 PET18YCR020C 648 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 MRP1YDR347W 966 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YPT31YER031C 672 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 SNU66YOR308C 1764 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 HXK1YFR053C 1458 nt9.13□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YMR206WYMR206W 942 nt9.12□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 GCD11YER025W 1584 nt9.12□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 RPL12BYDR418W 498 nt9.11□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YJL009WYJL009W 327 nt9.11□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 MRS4YKR052C 915 nt9.11□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YRF1-2YER190W 5046 nt9.1□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 PDC6YGR087C 1692 nt9.09□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 GDH1YOR375C 1365 nt9.09□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 ADE2YOR128C 1716 nt9.08□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 TMS1YDR105C 1422 nt9.08□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.08□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.08□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 BUB2YMR055C 921 nt9.08□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 UTR5YEL035C 501 nt9.07□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 RPS6AYPL090C 711 nt9.07□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 AAC3YBR085W 924 nt9.07□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 RPS6BYBR181C 711 nt9.07□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 ADA2YDR448W 1305 nt9.06□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 ALD5YER073W 1563 nt9.06□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 HXT10YFL011W 1641 nt9.05□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 PUS7YOR243C 2031 nt9.05□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 YER156CYER156C 1017 nt9.05□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 RHO1YPR165W 630 nt9.05□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 BXI1YNL305C 894 nt9.04□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 TAD2YJL035C 753 nt9.03□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 RNA170RNA170 169 nt9.03□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 THI73YLR004C 1572 nt9.03□□□□□ -0.96
CLF1Q12309 ELP4YPL101W 1371 nt9.01□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 NPP2YEL016C 1482 nt9.01□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 MDL2YPL270W 2322 nt9□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 TDH1YJL052W 999 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 MAM3YOL060C 2121 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 AAT1YKL106W 1356 nt8.99□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 AGP3YFL055W 1677 nt8.98□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 TOS1YBR162C 1368 nt8.97□□□□□ -0.97
CLF1Q12309 PUP3YER094C 618 nt8.94□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 ATP2YJR121W 1536 nt8.94□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 KAE1YKR038C 1161 nt8.93□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 YOR268CYOR268C 399 nt8.93□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 YBR056WYBR056W 1506 nt8.93□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 ECM10YEL030W 1935 nt8.93□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.92□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 MEP1YGR121C 1479 nt8.92□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 YIL168WYIL168W 384 nt8.92□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 snR86snR86 1004 nt8.91□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 PMU1YKL128C 888 nt8.91□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 ADE1YAR015W 921 nt8.91□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 PRE10YOR362C 867 nt8.91□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 YJL043WYJL043W 774 nt8.9□□□□□ -0.98
CLF1Q12309 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.89□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 SHC1YER096W 1539 nt8.89□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 NUP53YMR153W 1428 nt8.88□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 YEL023CYEL023C 2049 nt8.87□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 EDC2YER035W 438 nt8.87□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 PET494YNR045W 1470 nt8.87□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 JHD1YER051W 1479 nt8.85□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 YDR476CYDR476C 675 nt8.85□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 YGR137WYGR137W 375 nt8.85□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 FUS3YBL016W 1062 nt8.85□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 RCF1YML030W 480 nt8.84□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 TIM50YPL063W 1431 nt8.84□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 EHT1YBR177C 1356 nt8.84□□□□□ -0.99
CLF1Q12309 NBA1YOL070C 1506 nt8.83□□□□□ -1
CLF1Q12309 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.82□□□□□ -1
CLF1Q12309 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.82□□□□□ -1
CLF1Q12309 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.82□□□□□ -1
CLF1Q12309 YOR072WYOR072W 315 nt8.82□□□□□ -1
CLF1Q12309 NDE2YDL085W 1638 nt8.82□□□□□ -1
CLF1Q12309 MET8YBR213W 825 nt8.81□□□□□ -1
CLF1Q12309 INO1YJL153C 1602 nt8.8□□□□□ -1
CLF1Q12309 LRO1YNR008W 1986 nt8.8□□□□□ -1
CLF1Q12309 TRP2YER090W 1524 nt8.8□□□□□ -1
CLF1Q12309 PSP2YML017W 1782 nt8.79□□□□□ -1
CLF1Q12309 HXT8YJL214W 1710 nt8.79□□□□□ -1
CLF1Q12309 YIL177CYIL177C 5277 nt8.78□□□□□ -1
CLF1Q12309 FET5YFL041W 1869 nt8.77□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 SDH8YBR269C 417 nt8.77□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 MEX67YPL169C 1800 nt8.77□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 MFG1YDL233W 1377 nt8.76□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 LPD1YFL018C 1500 nt8.76□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 WSC3YOL105C 1671 nt8.76□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 PRE5YMR314W 705 nt8.76□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 BUD31YCR063W 474 nt8.75□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 HAC1YFL031W 717 nt8.75□□□□□ -1.01
CLF1Q12309 RRT6YGL146C 936 nt8.75□□□□□ -1.01
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