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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
YHR218W
YHR218W
1812 nt
7.53
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
HAL5
YJL165C
2568 nt
7.53
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
ODC1
YPL134C
933 nt
7.53
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
YRF1-2
YER190W
5046 nt
7.52
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
BEM1
YBR200W
1656 nt
7.52
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
LAS17
YOR181W
1902 nt
7.52
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
SMC5
YOL034W
3282 nt
7.51
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
YPL108W
YPL108W
507 nt
7.51
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
CRN1
YLR429W
1956 nt
7.51
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
YER152W-A
YER152W-A
567 nt
7.5
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
DPH5
YLR172C
903 nt
7.49
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
LSP1
YPL004C
1026 nt
7.49
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
YEN1
YER041W
2280 nt
7.48
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
CHS7
YHR142W
951 nt
7.48
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
OLA1
YBR025C
1185 nt
7.48
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
GGA2
YHR108W
1758 nt
7.47
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
BIM1
YER016W
1035 nt
7.47
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
YMR166C
YMR166C
1107 nt
7.47
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
YKR023W
YKR023W
1593 nt
7.46
□□□□□ -1.21
REX3
Q12090
BUD20
YLR074C
501 nt
7.46
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
CIR2
YOR356W
1896 nt
7.46
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
HDA1
YNL021W
2121 nt
7.46
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YDR467C
YDR467C
327 nt
7.45
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
SGV1
YPR161C
1974 nt
7.44
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
INH1
YDL181W
258 nt
7.43
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
MDM35
YKL053C-A
261 nt
7.43
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
GRH1
YDR517W
1119 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
RRT14
YIL127C
621 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
HRA1
HRA1
564 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
GPM1
YKL152C
744 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
EMC3
YKL207W
762 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
MFT1
YML062C
1179 nt
7.42
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YIR035C
YIR035C
765 nt
7.41
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YMR210W
YMR210W
1350 nt
7.41
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YPR084W
YPR084W
1371 nt
7.41
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
BAP3
YDR046C
1815 nt
7.41
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YJL160C
YJL160C
864 nt
7.4
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
YMC2
YBR104W
990 nt
7.4
□□□□□ -1.22
REX3
Q12090
CTF3
YLR381W
2202 nt
7.4
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
DPL1
YDR294C
1770 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
CMK2
YOL016C
1344 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
GGC1
YDL198C
903 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
CAK1
YFL029C
1107 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YMR206W
YMR206W
942 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YOR300W
YOR300W
309 nt
7.39
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YPT31
YER031C
672 nt
7.38
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YOR343C
YOR343C
327 nt
7.38
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
OCH1
YGL038C
1443 nt
7.37
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
AFG2
YLR397C
2343 nt
7.37
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YBL095W
YBL095W
813 nt
7.37
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
HEL1
YKR017C
1656 nt
7.37
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
MRP1
YDR347W
966 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YJL009W
YJL009W
327 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
MET22
YOL064C
1074 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
PAU21
YOR394W
495 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
PAU22
YPL282C
495 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
MET8
YBR213W
825 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
LEU4
YNL104C
1860 nt
7.36
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YAL016C-A
YAL016C-A
315 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YJR149W
YJR149W
1215 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
MRS4
YKR052C
915 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YMR316C-B
YMR316C-B
309 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
THI3
YDL080C
1830 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
YIL108W
YIL108W
2091 nt
7.35
□□□□□ -1.23
REX3
Q12090
RPL12B
YDR418W
498 nt
7.33
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
BUB2
YMR055C
921 nt
7.33
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
NBA1
YOL070C
1506 nt
7.32
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
TMS1
YDR105C
1422 nt
7.32
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
GDH1
YOR375C
1365 nt
7.32
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YRF1-3
YGR296W
5580 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YRF1-6
YNL339C
5580 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YRF1-7
YPL283C
5580 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YHC3
YJL059W
1227 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
AGP3
YFL055W
1677 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
PDC6
YGR087C
1692 nt
7.31
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YIL177C
YIL177C
5277 nt
7.3
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
MSB3
YNL293W
1902 nt
7.3
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
PET18
YCR020C
648 nt
7.29
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
YCR061W
YCR061W
1896 nt
7.29
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
CKI1
YLR133W
1749 nt
7.29
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
ASN2
YGR124W
1719 nt
7.28
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
RHO1
YPR165W
630 nt
7.28
□□□□□ -1.24
REX3
Q12090
tE(CUC)D
tE(CUC)D
72 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
tE(CUC)I
tE(CUC)I
72 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
YER156C
YER156C
1017 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
TAD2
YJL035C
753 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
RBS1
YDL189W
1374 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
YOS9
YDR057W
1629 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
ADA2
YDR448W
1305 nt
7.27
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
THI73
YLR004C
1572 nt
7.26
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
RPS6A
YPL090C
711 nt
7.26
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
RPS6B
YBR181C
711 nt
7.26
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
ADH6
YMR318C
1083 nt
7.25
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
NME1
NME1
340 nt
7.25
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
TDH1
YJL052W
999 nt
7.24
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
BXI1
YNL305C
894 nt
7.24
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
HXT13
YEL069C
1695 nt
7.23
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
UTR5
YEL035C
501 nt
7.23
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
PMU1
YKL128C
888 nt
7.23
□□□□□ -1.25
REX3
Q12090
AAT1
YKL106W
1356 nt
7.22
□□□□□ -1.25
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