Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.39□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YBL095WYBL095W 813 nt8.39□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.38□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.38□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.38□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 HOG1YLR113W 1308 nt8.38□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YMC2YBR104W 990 nt8.38□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YPR084WYPR084W 1371 nt8.37□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 ADA2YDR448W 1305 nt8.36□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 PUS7YOR243C 2031 nt8.36□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 EDC2YER035W 438 nt8.36□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 RRT14YIL127C 621 nt8.36□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 TOS1YBR162C 1368 nt8.35□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 CHS7YHR142W 951 nt8.35□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 TAD2YJL035C 753 nt8.35□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 NBA1YOL070C 1506 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 UTR5YEL035C 501 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 CAK1YFL029C 1107 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 YMR206WYMR206W 942 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 PRE5YMR314W 705 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 OLA1YBR025C 1185 nt8.34□□□□□ -1.07
SPE3Q12074 NPP2YEL016C 1482 nt8.33□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 MRS4YKR052C 915 nt8.33□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 YIL177CYIL177C 5277 nt8.33□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 ELP4YPL101W 1371 nt8.32□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 AAC3YBR085W 924 nt8.3□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 BAP3YDR046C 1815 nt8.3□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 OCH1YGL038C 1443 nt8.29□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 YIR035CYIR035C 765 nt8.29□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 YJR149WYJR149W 1215 nt8.29□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 TMS1YDR105C 1422 nt8.29□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 YPT31YER031C 672 nt8.28□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 RPS6AYPL090C 711 nt8.28□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 RPS6BYBR181C 711 nt8.28□□□□□ -1.08
SPE3Q12074 PET494YNR045W 1470 nt8.27□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 GAL2YLR081W 1725 nt8.27□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 YJL043WYJL043W 774 nt8.27□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 GNP1YDR508C 1992 nt8.27□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 AAT1YKL106W 1356 nt8.26□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 YJL009WYJL009W 327 nt8.26□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 TDH1YJL052W 999 nt8.26□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 TPN1YGL186C 1740 nt8.26□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 YER156CYER156C 1017 nt8.25□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 YJR154WYJR154W 1041 nt8.25□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 ADE1YAR015W 921 nt8.24□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 MET22YOL064C 1074 nt8.24□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 TOK1YJL093C 2076 nt8.23□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 BUB2YMR055C 921 nt8.23□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 BXI1YNL305C 894 nt8.23□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 MIM1YOL026C 342 nt8.23□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 UFD1YGR048W 1086 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 FUS3YBL016W 1062 nt8.22□□□□□ -1.09
SPE3Q12074 YPL247CYPL247C 1572 nt8.18□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 YDR476CYDR476C 675 nt8.18□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 NUP53YMR153W 1428 nt8.18□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 FIT1YDR534C 1587 nt8.18□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 snR86snR86 1004 nt8.17□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 PDC6YGR087C 1692 nt8.17□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 TRP2YER090W 1524 nt8.16□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 YIL168WYIL168W 384 nt8.16□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 THI6YPL214C 1623 nt8.16□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 FET5YFL041W 1869 nt8.15□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 HBS1YKR084C 1836 nt8.15□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 YBR056WYBR056W 1506 nt8.15□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 RHO1YPR165W 630 nt8.15□□□□□ -1.1
SPE3Q12074 LPD1YFL018C 1500 nt8.14□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 THI73YLR004C 1572 nt8.14□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 YLR358CYLR358C 564 nt8.12□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 RNA170RNA170 169 nt8.12□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 ATP2YJR121W 1536 nt8.11□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 DUR3YHL016C 2208 nt8.1□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 MEP1YGR121C 1479 nt8.1□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 HXT11YOL156W 1704 nt8.09□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 DUS3YLR401C 2007 nt8.09□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 COS10YNR075W 1125 nt8.09□□□□□ -1.11
SPE3Q12074 FRA1YLL029W 2250 nt8.08□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 RRT6YGL146C 936 nt8.07□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 HIS3YOR202W 663 nt8.06□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 NDE2YDL085W 1638 nt8.05□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 PMU1YKL128C 888 nt8.05□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 YLR072WYLR072W 2082 nt8.05□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 PUP3YER094C 618 nt8.04□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 LEA1YPL213W 717 nt8.04□□□□□ -1.12
SPE3Q12074 EHT1YBR177C 1356 nt8.03□□□□□ -1.12
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