Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 SWM1YDR260C 513 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS9Q12069 SOD2YHR008C 702 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS9Q12069 YLR460CYLR460C 1131 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS9Q12069 YMC2YBR104W 990 nt7.72□□□□□ -1.17
PUS9Q12069 THI3YDL080C 1830 nt7.71□□□□□ -1.17
PUS9Q12069 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.71□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 URH1YDR400W 1023 nt7.71□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.71□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 YBL095WYBL095W 813 nt7.7□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 FIT1YDR534C 1587 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 GCD11YER025W 1584 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 YPL108WYPL108W 507 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 DUR3YHL016C 2208 nt7.67□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 CHS7YHR142W 951 nt7.66□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 MRS4YKR052C 915 nt7.66□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 AGP3YFL055W 1677 nt7.66□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 UTP6YDR449C 1323 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 VAR1Q0140 1197 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 YIR035CYIR035C 765 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 ERG6YML008C 1152 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 YMR166CYMR166C 1107 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 OLA1YBR025C 1185 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 LSP1YPL004C 1026 nt7.65□□□□□ -1.18
PUS9Q12069 PET20YPL159C 762 nt7.64□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 NBA1YOL070C 1506 nt7.63□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 NPP2YEL016C 1482 nt7.63□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 MET30YIL046W 1923 nt7.63□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 YJL009WYJL009W 327 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 YJR149WYJR149W 1215 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 YJR154WYJR154W 1041 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 AAC3YBR085W 924 nt7.62□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 TMS1YDR105C 1422 nt7.61□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 ECM10YEL030W 1935 nt7.61□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 MAM3YOL060C 2121 nt7.61□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 CAK1YFL029C 1107 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 RRT14YIL127C 621 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 MET22YOL064C 1074 nt7.6□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 BUB2YMR055C 921 nt7.59□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 OCH1YGL038C 1443 nt7.59□□□□□ -1.19
PUS9Q12069 AAT1YKL106W 1356 nt7.59□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YNL190WYNL190W 615 nt7.58□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YJL160CYJL160C 864 nt7.57□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 HMT1YBR034C 1047 nt7.56□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YMR210WYMR210W 1350 nt7.55□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 PDC6YGR087C 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YPT31YER031C 672 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 EMC3YKL207W 762 nt7.54□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 POP2YNR052C 1302 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YHM2YMR241W 945 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 MIM1YOL026C 342 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 YPR084WYPR084W 1371 nt7.53□□□□□ -1.2
PUS9Q12069 MFT1YML062C 1179 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 RNA170RNA170 169 nt7.52□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 LAS17YOR181W 1902 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YCR099CYCR099C 468 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 snR86snR86 1004 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 SKG1YKR100C 1068 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YMR206WYMR206W 942 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YPL071CYPL071C 471 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 RHO1YPR165W 630 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 FET5YFL041W 1869 nt7.51□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 PET18YCR020C 648 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 snR78snR78 87 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YEL023CYEL023C 2049 nt7.5□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YBR056WYBR056W 1506 nt7.49□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 NDE1YMR145C 1683 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 GRH1YDR517W 1119 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 THI73YLR004C 1572 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 MEP1YGR121C 1479 nt7.48□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YIL177CYIL177C 5277 nt7.47□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 TRP2YER090W 1524 nt7.47□□□□□ -1.21
PUS9Q12069 YER156CYER156C 1017 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS9Q12069 RPS6AYPL090C 711 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS9Q12069 RPS6BYBR181C 711 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS9Q12069 YJL045WYJL045W 1905 nt7.46□□□□□ -1.22
PUS9Q12069 HBS1YKR084C 1836 nt7.45□□□□□ -1.22
PUS9Q12069 FRT1YOR324C 1809 nt7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.8 ms