Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VgfQ0VGU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VgfQ0VGU4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
VgfQ0VGU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VgfQ0VGU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VgfQ0VGU4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VgfQ0VGU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VgfQ0VGU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VgfQ0VGU4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VgfQ0VGU4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms