Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col19a1Q0VF58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col19a1Q0VF58 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col19a1Q0VF58 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col19a1Q0VF58 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col19a1Q0VF58 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col19a1Q0VF58 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms