Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAGPQ0VAQ4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAGPQ0VAQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAGPQ0VAQ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms